Expresión génica diferencial 2019
Docente responsable: José Sotelo.
Colaboradores: Joaquina Farías (IIBCE)
Cronograma e información general sobre el módulo:Día 1 Martes 5/9. Teórico, 10-12 hs. Conceptos básicos sobre expresión génica diferencial en Biología del Desarrollo. Desarrollo del sistema nervioso. La diferenciación de motoneuronas como ejemplo para el estudio de redes tridimensionales de expresión génica diferencial determinantes en la diferenciación de un tipo celular. Día 2 Viernes 8/9. Teórico, 10-12 hs. Cómo estudiar la expresión génica diferencial utilizando aproximaciones de tipo transcriptómicas mediante microarrays y RNA-seq. Día 3 Martes 12/9. Teórico/seminario I, 10-11:30 hs. Práctico, 12 a 14, Salón 109. Día 4 Viernes 15/9. Teórico/seminario II, 10-11:30 hs. Práctico, 12 a 14, Salón 109.
Material disponible en la carpeta de Google Drive.
Revisiones de apoyo al teórico y práctico:
How to make motor neurons.
Mid Blastula transition.
RNA-seq review.
Artículos, Dorso ventral RNA/seq, MBT RNA-seq RNA-seq X Laevis development.
Para los seminarios, dos grupos presentan las siguientes revisiones en el siguiente orden el Martes 12/9, 35 minutos cada uno.
1) Mid Blastula Transition
2) RNA-seq review.
Tres grupos que presentan los artículos el 15/9, 25 minutos cada uno en el orden siguiente:
1) Dorso Ventral RNA seq
2) MBT RNA/seq
3) X Laevis RNA-seq
Para la actividad práctica el artículo de apoyo es “Copy of Practico biol des art” (lectura obligatoria).
Direcciones WEB de apoyo. Aquí podrán realizar mediciones directas sobre la expresión génica diferencial durante el desarrollo de Xenopus.
http://www.xenbase.org/entry/doNewsRead.do?id=214
http://genomics.crick.ac.uk/apps/profiles/
Revisiones de apoyo para el Teórico y Practico
1- How to make motor neurons. (How to make spinal motor neurons 2014. Brandi N. Davis-Dusenbery Luis A. Williams, Joseph R. Klim and Kevin Eggan, Development 2014)
2- Zygotic Genome Activation During the Maternal-to-Zygotic Transition. Miler T. Lee,1,∗ Ashley R. Bonneau,1,∗and Antonio J. Giraldez1,2
3- RNA-seq Review. RNA sequencing: advances, challenges and opportunities. Fatih Ozsolak and Patrice M. Milos
